Čo je to PGT-SR?

​

Preimplantačné genetické testovanie na štrukturálne chromozómové defekty (PGT-SR) je metóda, ktorá umožňuje zistiť chromozómové abnormality u embryí párov, kde sa u jedného alebo oboch partnerov preukázala vyvážená translokácia alebo iná štrukturálna aberácia. Translokácie sú najčastejšími štrukturálnymi chromozómovými abnormalitami, ktoré sa vyskytujú s frekvenciou približne 1:625.

 

U jedincov, ktorí sú nositeľmi vyváženej translokácie, sa nevyskytujú žiadne vývojové chyby ani iné postihnutia alebo ochorenia. Problém však nastáva v prípade reprodukcie, keď sa môžu vyprodukovať spermie alebo vajíčka, ktoré neobsahujú správne množstvo genetického materiálu, t. j. časť z neho chýba alebo nie je prítomná. Ak sa takéto spermie a vajíčka zúčastňujú na oplodnení, môže dôjsť k zastaveniu vývoja embrya, zníženiu implantačného potenciálu alebo k potratu plodu s vývojovou chybou. Niektoré typy translokácií môžu tiež zvyšovať riziko Downovho syndrómu.

Pre koho je PGT-SR vhodné?

PGT-SR je vhodná pre pacientov s recipročnou alebo robertsonovskou translokáciou, pri ktorej sú dve oblasti medzi dvoma rôznymi chromozómami vymenené, a pre pacientov s inverziou, pri ktorej je oblasť v rámci chromozómu otočená.

Ako to funguje?

Metóda PGT-SR, podobne ako metóda PGT-A, využíva technológiu masívneho paralelného sekvenovania (MPS). Počas prípravy vzorky sa DNA embryí mnohonásobne znásobí a potom sa "sekvenuje" čítaním sekvencie DNA všetkých 23 párov ľudských chromozómov. Informácie o počte takto prečítaných sekvencií sa potom softvérovo porovnávajú s kontrolnou vzorkou, ktorá má vždy správny počet kópií všetkých chromozómov. Týmto spôsobom môžeme zistiť, či sú určité sekvencie v genóme embrya nadmerne zastúpené alebo chýbajú. Týmto spôsobom sme schopní zistiť numerické aberácie všetkých ľudských chromozómov a vybrať na prenos euploidné embryá nezaťažené chromozómovými aberáciami, ktoré sú výsledkom vývoja reprodukčných buniek nesúcich translokácie alebo inverzie.

Aká je výhoda PGT-SR s využitím MPS?

Keďže v rámci metódy PGT-SR vyšetrujeme aj všetky zostávajúce chromozómy embrya, ktoré nie sú zapojené do translokácie, môžeme vďaka technológii MPS vykonať aj preimplantačné genetické testovanie na aneuploidiu všetkých chromozómov (PGT-A) v rámci jedného testu. Na rozdiel od doteraz používanej porovnávacej genomickej hybridizácie na čipe (aCGH) nám metóda MPS umožňuje testovať až 96 embryí v jednej reakcii. Zároveň nám poskytuje oveľa vyššie rozlíšenie, čo znamená oveľa lepšiu detekciu tzv. segmentálnych aneuploidií, pri ktorých je v bunkách embrya prítomná alebo chýba len určitá časť chromozómu a ktoré sú veľmi často výsledkom vzájomnej translokácie. Okrem toho vyšší dynamický rozsah sekvenačných metód poskytuje presnejšie informácie o tzv. chromozómovom mozaicizme, t. j. situácii, keď sa v ľudskom embryu vyskytujú bunkové línie s normálnym počtom chromozómov a aneuploidné bunkové línie.