Čo je PGT-M?

​

Preimplantačné genetické testovanie monogénových ochorení (PGT-M), predtým preimplantačná genetická diagnostika (PGD), je určené pre páry, u ktorých je preukázané riziko prenosu závažného genetického ochorenia, ktoré sa prenáša z rodiča na potomka prostredníctvom jednej génovej poruchy. PGT-M sa v našom laboratóriu vykonáva od roku 2014 metódou karyomapping a od roku 2021 aj nami vyvinutou metódou OneGene PGT.

 

 

Čo je karyomapping?

​​

Karyomapovanie je univerzálna metóda kombinujúca preimplantačné genetické testovanie monogénnych ochorení (PGT-M) a preimplantačné genetické testovanie aneuploidií (PGT-A) vyšetrovaných embryí v jednom teste, ktorá umožňuje vybrať euploidné embryo bez genetickej záťaže s najvyšším implantačným potenciálom.

​

Čo je OneGene PGT?

 

Metóda OneGene PGT podobne ako Karyomapping kombinuje preimplantačné genetické testovanie monogénnych ochorení a aneuploidií v jednom teste. Okrem toho táto nová metóda umožňuje priamu detekciu mutácií v embryách.

V súčasnosti je metóda akreditovaná pre tieto ochorenia: cystická fibróza (gén CFTR), dedičná rakovina prsníka a vaječníkov (BRCA1 a BRCA2), hemoglobinopatia (HBB), Huntingtonova choroba (HTT), syndróm fragmentovaného chromozómu X (FMR1) a nesyndrómová hluchota (GJB2).

 

Pre koho je PGT-M vhodné?

​

PGT-M je určený pre všetky páry s genetickou záťažou v rodine, ktoré plánujú tehotenstvo a chcú mať istotu zdravého potomka. karyomapping možno použiť na všetky ochorenia s mendelistickým typom dedičnosti (autozomálne dominantné/recesívne, X- viazané), OneGene PGT na ochorenia spojené so 7 vybranými génmi.

 

Čo je potrebné vedieť pred začatím PGT-M?

​

Pred začatím IVF s PGT-M je nevyhnutné poznať príčinnú mutáciu spôsobujúcu genetické ochorenie.

v rodine. Na úspešnú analýzu sa musí okrem embryí testovať aj DNA oboch rodičov a referenčná vzorka so známym genotypom príčinnej mutácie. Typickým príkladom autozómovo recesívneho ochorenia sú rodičia, ktorí sú nositeľmi cystickej fibrózy, a referenčnou vzorkou je ich dieťa s diagnostikovanou cystickou fibrózou. V určitých situáciách sa test môže vykonať bez referenčnej vzorky (de-novo mutácia). V týchto prípadoch sa embryá dodatočne podrobia priamej detekcii mutácií, ktorá v kombinácii s analýzou väzieb môže spoľahlivo odhaliť, ktoré embryá sú bez genetickej záťaže. V tomto prípade je veľmi dôležité najprv sa poradiť s naším genetickým laboratóriom o možnosti vykonania testu.

 

Ako to funguje?

​

Karyomapovanie využíva viac ako 300 000 polymorfných sekvencií (tzv. SNP) rovnomerne rozmiestnených v genóme na nepriamu diagnostiku monogénnych ochorení. Analýzou týchto sekvencií sa vytvorí tzv. karyomapa, ktorá vizualizuje rozloženie haplotypov všetkých chromozómov vrátane kríženia v skúmanom embryu. V prvom kroku sa identifikujú informatívne SNP na určenie každého zo štyroch rodičovských haplotypov (dva otcovské haplotypy označované ako P1 a P2 a dva materské haplotypy M1 a M2), ktoré zjednodušene predstavujú každý zo štyroch rodičovských chromozómov. Tieto informatívne SNP sa potom porovnajú s genotypom referenčnej vzorky, aby sa určila "fáza", ktorá predstavuje, ktoré dva zo štyroch rodičovských haplotypov referenčná vzorka zdedila. V uvedenom prípade, keď sú obaja rodičia nositeľmi cystickej fibrózy a referenčným dieťaťom je ich dieťa s cystickou fibrózou, je možné určiť, ktoré rodičovské haplotypy predstavujú haplotypy s kauzálnymi mutáciami. Posledným krokom je porovnanie týchto haplotypov v referenčných a skúmaných embryách. Ak sa v embryu identifikujú rovnaké haplotypy ako v referenčnej vzorke, možno spoľahlivo predpovedať, že embryo zdedilo obe mutované alely cystickej fibrózy na základe nepriamej diagnostiky podporenej desiatkami informatívnych SNP v okolí mutácie.

​

Metóda OneGene PGT funguje na rovnakom princípe ako karyomapping s tým rozdielom, že skúmané markery SNP nie sú rozmiestnené v celom genóme, ale len v oblasti okolo skúmaného génu. Na rozdiel od karyomapovania je OneGene PGT založená na sekvenovaní novej generácie (NGS), ktoré nám vo väčšine prípadov umožňuje odhaliť príčinnú mutáciu priamo v embryu. Tým sa zvyšuje spoľahlivosť analýzy haplotypových väzieb.

 

Aké sú výhody metódy karyomappingu?

​

Jednou z hlavných výhod karyomappingu je jeho všestrannosť. Vďaka rovnomernému pokrytiu informatívnych SNP v celom genóme umožňuje skúmať skutočne akékoľvek genetické ochorenie s kauzálnou mutáciou. Vďaka tejto univerzálnosti nie je potrebná zdĺhavá optimalizácia postupu pre konkrétnu rodinu, ktorá zvyčajne trvá niekoľko mesiacov, a testovanie sa dá vykonať podstatne rýchlejšie v priebehu niekoľkých týždňov. Ďalšou výhodou je súčasná detekcia aneuploidií v skúmaných embryách, čo výrazne zvyšuje šancu na úspech liečby.

​

Aké sú výhody metódy OneGene PGT?

​

Vďaka použitiu technológie NGS nám metóda OneGene PGT umožňuje aj priamu detekciu mutácií v embryách, čo výrazne zvyšuje spoľahlivosť testu. NGS tiež poskytuje lepšie rozlíšenie pri detekcii chromozómových aberácií a chromozómového mozaicizmu v embryách v porovnaní s čipovou technológiou metódy Karyomapping. V neposlednom rade je táto nová metóda časovo a finančne efektívnejšia.